Die Entwickler erzählen in diesem “Spider-Man”-Spiel eine eigene Geschichte. Mit den diversen Kinofilmen hat das Spiel also nichts zu tun. Der Spieler schlüpft in die Rolle eines bereits erfahrenen Peter Parker, der die Stadt New York seit acht Jahren kennt und von der Bevölkerung als Spider-Man geschätzt wird. Die Geschichte des Spiels beinhaltet nicht nur die Verbrechensbekämpfung gegen fiese Gangsterbosse, sondern auch das turbulente Privatleben von Peter Parker. Zahlreiche bekannte Charaktere aus der Spider-Man-Serie – wie Peters Freundin MJ – tauchen dabei ebenfalls auf.

Als Spider-Man werden wir von der Polizistin Yuri Watanabe mit Aufträgen versorgt. Wir folgen der Hauptgeschichte oder schwingen frei durch die Straßen des originalgetreu nachgebildeten New Yorks und suchen Verbrecher auf. Gegner werden im Kampf von Spider-Man vermöbelt, es gibt aber auch die Möglichkeit, taktisch vorzugehen und Feinde lautlos auszuschalten. Der Spieler muss dafür vorsichtig agieren und darf nicht entdeckt werden. Neben der Hauptgeschichte gibt es zahlreiche Nebenmissionen in Manhattan. So können wir auch als Fotograf tätig werden und die vielen Wahrzeichen in New York im richtigen Licht festhalten.